Los SMS, en serio. Las comunicaciones GSM/GPRS/UMTS ya van cifradas, y lo que es más importante, están protegidas por la ley. La única pega es que la misma ley contempla su interceptación.

Por otro lado, en cualquier servicio de terceros tienes el riesgo de que se almacenen los mensajes, algo que si te lo hiciera tu operadora te habría tocado la lotería por la pasta que les podrías sacar en indemnizaciones (por no hablar de las consecuencias penales para los responsables). Si embargo, si te lo hace Skype ¿contra quién vas? porque si el servicio está fuera de España las probabilidades de que el juez solicite una comisión rogatoria y que esta avance son realmente escasas.

Por seguir dando un rato la brasa, la ventaja de los SMS es que la red sólo los entrega a la línea identificada con un IMSI concreto, es decir, que si tuvieras varias tarjetas SIM con el mismo número de teléfono, como el IMSI es diferente para cada una de ellas, sólo se entregaría a una de ellas, además, si el mensaje no se entrega inmediatamente la red sólo lo conserva durante un tiempo limitado (suelen ser unas pocas horas).

El resto de servicios funcionan de otra manera menos segura, porque los mensajes no se entregan, sino que es el terminal el que los recoge identificándose previamente. Esto quiere decir que desde cualquier equipo conectado a Internet se podría intentar acceder al servicio para solicitar los mensajes (que normalmente no se sabe durante cuánto tiempo se almacenan) y luego descifrarlos.

Mi recomendación es que uses SMS (y quien dice SMS dice MMS o mensajería de archivos, que en el fondo es más o menos lo mismo) y que si quieres un nivel adicional, el texto del mensaje lo envíes cifrado previamente con cualquier aplicación, pero que no uses servicios de terceros, salvo, como mucho Blackberry.